Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MEFVO15553 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MEFVO15553 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MEFVO15553 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MEFVO15553 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MEFVO15553 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MEFVO15553 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MEFVO15553 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MEFVO15553 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MEFVO15553 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MEFVO15553 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MEFVO15553 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MEFVO15553 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms