Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms