Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PIK3C2AO00443 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms