Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms