Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP17L21D6R901 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms