Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN25C9JDP6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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