Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A6NL46 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A6NL46 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A6NL46 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A6NL46 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A6NL46 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A6NL46 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A6NL46 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A6NL46 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A6NL46 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A6NL46 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A6NL46 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A6NL46 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A6NL46 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms