Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms