Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALM3A6NDB9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms