Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4D1N5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4D1N5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
A4D1N5 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
A4D1N5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
A4D1N5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
A4D1N5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
A4D1N5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
A4D1N5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
A4D1N5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
A4D1N5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
A4D1N5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
A4D1N5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
A4D1N5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms