Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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