Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms