Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN3Q13064 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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