Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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SGCBQ16585 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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SGCBQ16585 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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SGCBQ16585 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCBQ16585 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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