Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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