Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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