Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1BQ13112 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1BQ13112 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms