Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN3Q13064 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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