Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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