Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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