Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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