Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEUROD1Q13562 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms