Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms