Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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