Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PSDA5PKW4 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms