Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms