Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms