Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HDAC1Q13547 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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