Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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