Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCINQ13939 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCINQ13939 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCINQ13939 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCINQ13939 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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CCINQ13939 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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CCINQ13939 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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CCINQ13939 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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CCINQ13939 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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CCINQ13939 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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CCINQ13939 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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CCINQ13939 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCINQ13939 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCINQ13939 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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