Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPREP23469 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPREP23469 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPREP23469 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPREP23469 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPREP23469 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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