Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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PTGDRQ13258 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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PTGDRQ13258 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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PTGDRQ13258 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTGDRQ13258 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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