Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HLA-CQ95604 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms