Protein–RNA interactions for Protein: Q17RN3

FAM98C, Protein FAM98C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM98CQ17RN3 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FAM98CQ17RN3 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FAM98CQ17RN3 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms