Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
VGFO15240 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VGFO15240 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VGFO15240 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VGFO15240 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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