Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A4Q9Y6R1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms