Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF8Q9UPP1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms