Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BARX2Q9UMQ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BARX2Q9UMQ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms