Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PADI1Q9ULC6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms