Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RARRES3Q9UL19 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms