Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN16Q9UKR8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms