Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms