Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms