Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms