Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4Q9UBX2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms