Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CNTN3Q9P232 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN3Q9P232 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms