Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms