Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms