Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms