Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms